Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms