Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms