Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms