Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rnf122-201ENSMUST00000046941 3582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Zfp408-201ENSMUST00000099714 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Spn-201ENSMUST00000049931 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj10-201ENSMUST00000056136 5407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rc3h2-203ENSMUST00000112936 5828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc11-201ENSMUST00000062904 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Kctd19-202ENSMUST00000167294 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Optn-202ENSMUST00000114996 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pus7-206ENSMUST00000148618 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1221-203ENSMUST00000213404 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpk-224ENSMUST00000224182 2754 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Sdhaf2-201ENSMUST00000025570 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Mink1-204ENSMUST00000102558 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Slco2b1-201ENSMUST00000032985 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pld1-203ENSMUST00000123539 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Slco4a1-201ENSMUST00000038225 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm26583-201ENSMUST00000181436 3684 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 AU021092-201ENSMUST00000050160 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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