Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms