Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Sh3bp1P55194 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Sh3bp1P55194 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Sh3bp1P55194 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Sh3bp1P55194 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Sh3bp1P55194 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms