Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr6-202ENSMUST00000213552 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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