Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprkP35822 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms