Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
Hoxd10P28359 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms