Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TP20293 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TP20293 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TP20293 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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