Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Cldn34c3J3QJW5 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms