Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms