Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Rnf217D3YYI7 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Rnf217D3YYI7 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Rnf217D3YYI7 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Rnf217D3YYI7 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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Rnf217D3YYI7 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Rnf217D3YYI7 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rnf217D3YYI7 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Rnf217D3YYI7 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnf217D3YYI7 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rnf217D3YYI7 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf217D3YYI7 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf217D3YYI7 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf217D3YYI7 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf217D3YYI7 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rnf217D3YYI7 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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