Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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PtprbB2RU80 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprbB2RU80 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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