Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Snhg14-206ENSMUST00000187666 2517 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Trpd52l3-201ENSMUST00000025727 2231 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Sp1-202ENSMUST00000163709 3134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC156273.1-201ENSMUST00000214570 2762 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Zmym5-201ENSMUST00000039812 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Sub1-201ENSMUST00000022816 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Slco4a1-201ENSMUST00000038225 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Zscan26-202ENSMUST00000110485 4366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hdac5Q9Z2V6 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms