Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Cnga3Q9JJZ8 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Cnga3Q9JJZ8 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms