Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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