Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC155941.2-201ENSMUST00000218795 1861 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm19144-201ENSMUST00000221921 1859 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ufl1-202ENSMUST00000102994 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Riok3Q9DBU3 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms