Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nup155Q99P88 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nup155Q99P88 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nup155Q99P88 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Nup155Q99P88 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nup155Q99P88 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms