Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Pacsin3Q99JB8 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Pacsin3Q99JB8 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms