Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Atg16l1Q8C0J2 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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