Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms