Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms