Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc18Q640L5 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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