Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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