Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Treml4Q3LRV9 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Treml4Q3LRV9 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Treml4Q3LRV9 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Treml4Q3LRV9 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Treml4Q3LRV9 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Gm45280-201ENSMUST00000210484 2552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Treml4Q3LRV9 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms