Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm37649-201ENSMUST00000192079 2232 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Sec23a-204ENSMUST00000165134 2529 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Perm1Q149B8 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms