Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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PrkcqQ02111 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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PrkcqQ02111 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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PrkcqQ02111 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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PrkcqQ02111 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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PrkcqQ02111 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrkcqQ02111 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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