Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Hoxd13P70217 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Hoxd13P70217 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Hoxd13P70217 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd13P70217 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms