Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SbdsP70122 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms