Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SrprbP47758 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SrprbP47758 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms