Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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