Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprmP28828 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms