Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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