Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Prkar1a-203ENSMUST00000106677 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prim1P20664 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prim1P20664 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prim1P20664 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Wdpcp-201ENSMUST00000020568 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Nek10-202ENSMUST00000112630 3348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prim1P20664 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.5 ms