Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Ccl20O89093 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Ccl20O89093 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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Ccl20O89093 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Ccl20O89093 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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