Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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H2-M1F7CXU4 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
H2-M1F7CXU4 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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