Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmf1B9EKI3 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmf1B9EKI3 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmf1B9EKI3 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmf1B9EKI3 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmf1B9EKI3 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmf1B9EKI3 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmf1B9EKI3 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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