Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ythdc2B2RR83 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ythdc2B2RR83 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms