Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms