Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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