Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnft1Q9DCN7 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms