Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf6Q9DBU5 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf6Q9DBU5 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Rnf6Q9DBU5 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf6Q9DBU5 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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