Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NubplQ9CWD8 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms