Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms