Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms