Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Dsg1bQ7TSF1 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Dsg1bQ7TSF1 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms