Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CtifQ6PEE2 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms