Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm5120-201ENSMUST00000215231 2414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Egf-209ENSMUST00000199615 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Supt7l-201ENSMUST00000065388 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms