Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm6989-201ENSMUST00000218409 654 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sft2d1Q5SSN7 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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